Engineered Zinc Finger Proteins: Methods and Protocols

در میان بسیاری از انواع دامنه‌های اتصال به DNA، پروتئین‌های انگشت روی C2H2 (ZFPs) ثابت شده‌اند که برای ایجاد پروتئین‌های اتصال به DNA سفارشی، انعطاف‌پذیرترین هستند. در مقاله پروتئین‌های انگشت روی مهندسی شده: روش‌ها و پروتکل‌ها، محققان متخصص از برخی از فعال‌ترین آزمایشگاه‌ها در این زمینه روش‌ها، راهنمایی‌ها و دیدگاه‌های دقیقی را ارائه می‌کنند. این جلد شامل بخش‌هایی است که مهندسی ZFPها، روش‌های ایجاد، ارزیابی و تحویل فاکتورهای رونویسی مصنوعی (ATFs)، روش‌های ایجاد و ارزیابی هسته‌های انگشت روی (ZFNs)، و مجموعه‌ای از چندین کاربرد و سنجش را پوشش می‌دهد. فراتر از ATF ها و ZFN ها، از جمله ترانسپوزازهای انگشت روی و روش شناسی ChiP-seq در میان موضوعات دیگر. این فصل‌ها که در قالب‌های بسیار موفق سری Methods in Molecular Biology™ نوشته شده‌اند، شامل مقدمه‌ای بر موضوعات مربوطه، فهرستی از مواد و معرف‌های لازم، پروتکل‌های آزمایشگاهی گام به گام و به آسانی قابل تکرار و یادداشت‌هایی در مورد عیب‌یابی و اجتناب از مشکلات شناخته شده است. پروتئین‌های انگشت روی مهندسی شده: روش‌ها و پروتکل‌های جامع و پیشرفته با هدف کمک به پزشکان باتجربه و محققین جدید با روش‌ها و بینش‌های حیاتی خود در تلاش برای ایجاد نسل بعدی ZFP‌ها و برنامه‌های کاربردی مهندسی‌شده است.

Among the many types of DNA binding domains, C2H2 zinc finger proteins (ZFPs) have proven to be the most malleable for creating custom DNA-binding proteins. In Engineered Zinc Finger Proteins: Methods and Protocols, expert researchers from some of the most active laboratories in this field present detailed methods, guidance, and perspectives. The volume contains sections covering the engineering of ZFPs, methods for the creation, evaluation, and delivery of artificial transcription factors (ATFs), methods for the creation and evaluation of zinc finger nucleases (ZFNs), and a collection of the several applications and assays beyond ATFs and ZFNs, including zinc finger transposases and ChIP-seq methodology amongst other subjects. Written in the highly successful Methods in Molecular Biology™ series format, chapters include introductions to their respective topics, lists of the necessary materials and reagents, step-by-step, readily reproducible laboratory protocols, and notes on troubleshooting and avoiding known pitfalls. Comprehensive and cutting-edge, Engineered Zinc Finger Proteins: Methods and Protocols aims to aid both seasoned practitioners and new investigators with its vital methods and insights as they seek to create the next generation of engineered ZFPs and applications.